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據初步統計，現行稅制共對高新技術產業(yè)開發(fā)區(qū)、經濟技術開發(fā)區(qū)等21類特殊區(qū)域實行了區(qū)別對待的稅收優(yōu)惠政策，以適應改革開放和我國經濟梯度開發(fā)與促進區(qū)域經濟振興的需要，如：對包括中部6省的26個老工業(yè)基地城市的八大行業(yè)實行消費型增值稅改革試點、統一對研發(fā)費用所得稅前加計扣除、實行企業(yè)技改設備投資抵免新增所得稅、科技成果轉化免征相關稅收、內外資項目投資總額內進口設備免稅、進口科教用品免稅、高新區(qū)內高新技術企業(yè)及軟件與集成電路產業(yè)實行減免稅、對科技創(chuàng)新與科學普及減免稅等。據不完全統計，2003年，僅對高新技術企業(yè)減免稅收就達250億元，2004年科技稅收減免合計達到700多億元。現行涉稅法規(guī)及具體稅收政策有效地提高了企業(yè)科技創(chuàng)新的積極性和主動性，也充分發(fā)揮了高科技園區(qū)等特定區(qū)域的輻射和平臺作用。

現行政策仍存在問題

從現行稅制的運行實踐分析，現行促進科技進步的稅收政策也存在一些亟待解決的問題。

區(qū)域優(yōu)惠力度大、層次多，產業(yè)優(yōu)惠相對較弱且導向不夠清晰。目前，21個大類的區(qū)域稅收優(yōu)惠政策范圍廣、內容豐富，雖然也體現對高科技產業(yè)的扶持，但產業(yè)稅收優(yōu)惠過于偏重對利潤的調節(jié)，特別是區(qū)域普惠稅收優(yōu)惠政策在一定程度上減弱了鼓勵高科技產業(yè)發(fā)展的導向功能。

稅收激勵政策較多偏重于創(chuàng)新結果而不是扶持創(chuàng)新過程，影響了稅收政策的效果。如：企業(yè)已被確認為高新技術企業(yè)或研發(fā)形成科技成果轉讓時，才能享受相關優(yōu)惠政策；加速折舊、投資抵免等扶持科技產業(yè)化的間接稅收優(yōu)惠政策受制于各種因素無法充分落實；因居民管轄權、稅收抵免等因素的制約，外商投資企業(yè)享受的稅收優(yōu)惠部分成為了發(fā)達國家的財政收入。

稅收扶持政策缺乏系統性，政策效應有待進一步提高?，F行促進科技進步的稅收優(yōu)惠政策幾乎散見于現行稅制的各個稅種，但都具有特定的適用條件，如高新區(qū)內高新技術企業(yè)與區(qū)外企業(yè)稅收待遇不一致，影響了企業(yè)的公平競爭。對科技企業(yè)采取增值稅、進口環(huán)節(jié)稅等優(yōu)惠政策，影響了增值稅制度的規(guī)范，也存在替資及財政支出等問題，越位嚴重。而對科技基礎研究、風險投資、產學研結合等的稅收優(yōu)惠政策支持力度不夠，存在一定的缺位現象。特別是部分稅收優(yōu)惠政策實施需要主管部門對優(yōu)惠主體進行認定與管理，存在一定的政策“博弈”現象。

稅收政策選擇

經濟發(fā)展實踐表明，高科技成果的轉化與應用、引進設備與技術、加大研發(fā)費用投入等是市場主體增強核心競爭力、追求高收益的成本，應由市場機制發(fā)揮其基礎性的作用，政府不能替代企業(yè)進行市場決策。稅收扶持政策只是鼓勵企業(yè)發(fā)展高科技的“引子”，著重要為企業(yè)創(chuàng)造公平創(chuàng)新的稅收環(huán)境。

改革和完善主體稅種，增強增值稅和企業(yè)所得稅對發(fā)展高科技產業(yè)的適應性。

積極推進增值稅轉型改革，允許企業(yè)抵扣外購機器設備等固定資產的進項稅額，不僅可以進一步消除重復征稅，鼓勵企業(yè)進行技術和設備投資，促進產業(yè)結構調整和技術升級，提高產品的國際競爭力。也可以減輕企業(yè)稅收負擔，鼓勵企業(yè)增加科技創(chuàng)新的投資力度。當前應認真總結增值稅轉型在東北地區(qū)與中部部分老工業(yè)基地城市試點的經驗，密切關注宏觀經濟的總體態(tài)勢，進一步完善全國統一實施的增值稅轉型改革方案，在條件成熟時，在全國范圍內統一實施增值稅轉型改革。而新的企業(yè)所得稅法及擬議中的企業(yè)所得稅法實施條例將對現行企業(yè)所得稅稅前扣除政策予以規(guī)范，對高新技術企業(yè)實行15%的所得稅低稅率，以充分體現企業(yè)發(fā)展高科技對勞動力、資本和技術補償的需要，在淡化區(qū)域所得稅優(yōu)惠政策的同時，強化以產業(yè)優(yōu)惠為主、輔以區(qū)域優(yōu)惠和兼顧社會發(fā)展的所得稅優(yōu)惠政策體制，促進高新技術產業(yè)發(fā)展、鼓勵企業(yè)研發(fā)和增加資源能源節(jié)約利用。由于高科技園區(qū)主要集聚的是資金、技術密集型企業(yè)，因此，高科技產業(yè)將成為增值稅和企業(yè)所得稅改革的主要得益者。

規(guī)范稅收政策，促進科技創(chuàng)新和經濟增長。

高科技產業(yè)發(fā)展、企業(yè)技術進步涉及的內容十分廣泛，對企業(yè)技術開發(fā)費、設備更新、創(chuàng)業(yè)投資以及孵化器、大學科技園給予必要的稅收優(yōu)惠，有利于從根本上增強企業(yè)的自主創(chuàng)新和消化吸收能力，促進“高、精、尖”技術的應用與產業(yè)結構的升級、優(yōu)化。更好地體現稅收對高科技產業(yè)發(fā)展的引導作用。根據國務院關于《國家中長期科學和技術發(fā)展規(guī)劃綱要（2006-2010年）》以及國務院《關于印發(fā)實施<國家中長期科學和技術發(fā)展規(guī)劃綱要（2006-2010年）>若干配套政策的通知》的有關規(guī)定精神，財政部會同有關部門研究制定了促進高科技產業(yè)發(fā)展的具體稅收政策，促進了企業(yè)公平競爭和技術創(chuàng)新。

一是積極運用間接優(yōu)惠方式，推動企業(yè)科技進步。如：借鑒國際經驗，采用加速折舊、投資抵免、虧損彌補、費用扣除等多種方式，將企業(yè)計稅工資稅前扣除限額統一提高到人均每月1600元；對企業(yè)當年的研發(fā)費用支出實行150%的所得稅前加計扣除，不足抵扣部分可在以后5年內結轉抵扣；對企業(yè)當年提取并實際使用的職工教育經費按計稅工資總額的2.5%實行企業(yè)所得稅稅前扣除；對企業(yè)用于研究開發(fā)的儀器和設備，單位價值在30萬元以下的，可一次或分次計入成本費用，單位價值超過30萬元的實行雙倍余額遞減法或年數總和法等加速折舊措施，進一步降低了企業(yè)科技創(chuàng)新的成本，有效地激勵了高科技企業(yè)進行的技術創(chuàng)新活動。

二是進一步完善了促進高新技術企業(yè)的稅收優(yōu)惠政策。自2006年1月1日起，國家對高新技術產業(yè)開發(fā)區(qū)內新創(chuàng)辦的高新技術企業(yè)，自獲利年度起兩年內免征企業(yè)所得稅，免稅期滿后減按15%的稅率征收企業(yè)所得稅。同時，將抓緊研究動漫產業(yè)、信息服務以及服務外包等促進現代服務業(yè)發(fā)展的有關稅收扶持措施。

三是運用稅收政策引導社會資金支持和發(fā)展高科技產業(yè)、企業(yè)和產品。稅收優(yōu)惠政策除了可以減少創(chuàng)新活動的成本，增加企業(yè)投資收益，從而增強企業(yè)投資創(chuàng)新活動的資金能力之外，還可以引導社會資金投資于中小型高新技術企業(yè)，緩解中小型科技企業(yè)融資難、創(chuàng)新難等問題?，F行稅收政策規(guī)定，對企事業(yè)單位通過公益性的社會團體和國家機關向科技型中小企業(yè)技術創(chuàng)新基金的捐贈，企業(yè)在年度企業(yè)所得稅應納稅所得額3％以內的部分，個人在申報個人所得稅應納稅所得額30％以內的部分，準予在計算繳納所得稅稅前扣除；對創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)采取股權投資方式投資于未上市中小高新技術企業(yè)2年以上可按其對中小高新技術企業(yè)投資額的70%抵扣該創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)的應納稅所得額。

四是完善稅收政策鼓勵科技成果的轉化。為進一步完善科技中介服務機構的稅收優(yōu)惠政策，國家對符合條件的孵化器、大學科技園實行3年免征營業(yè)稅、房產稅和城鎮(zhèn)土地使用稅政策；對符合非營利組織條件的孵化器、大學科技園收入統一執(zhí)行新的企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策。